纯种；即纯合体，严格来讲是由两个基因型完全相同的配子结合成的合子发育成的个体。在生物学角度来讲，完全的纯种是不存在的，一方面由于基因在不断的变异，另一方面由于基因的遗传效应不但要遵循孟德尔遗传定律，并且要遵循基因的连锁与交换定律，这样能够产生纯合体的几率就底了。纯种，主要是由近亲交配或自体受粉而产生的个体，在有关目标基因的组成上不存在杂合性；一般来说，是指一对或数对目标基因为纯合型的个体。纯系则是指所有有关的基因构成为纯合型的个体可以认为是纯种的一种特殊情况。
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