1、症状不同：病毒感染后，患者比较容易出现的症状就是持续发热的表现，常常会持续出现高热的现象，可伴有四肢酸痛、全身乏力等症状，血常规提示，淋巴细胞计数升高等。细菌感染后患者会容易出现咽喉疼痛、咳嗽以及咳痰等症状，出现胃肠症状时，会有发热腹泻表现，或者有里急后重等表现，血常规检查，会有白细胞计数升高的表现。
2、辅助检查不同：病毒感染通过病毒培养或者是核酸检测，而细菌感染需要做分泌物或者是血培养确诊。
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